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吐槽上海生物工程公司的测序服务

时间:2019-09-30 16:46来源:人科学blog 作者:白雪 点击:
上海生物工程有限公司的测序服务
鉴于实验研究的需要,疾病诊治方面的发展,近期委托上海生物工程有限公司进行了一次全外显子的高通测序。
测序结果,以上传到对方服务器上,予本地用户下载。

本来这个服务数据的传输是很有先进性的,恐怕很多公立单位是无法做到这一点的。但是,对于一个公司的逐利性来说这样做的目的也是可以省钱的一种方法。当然,因为有服务器,这种方法也有它的弊端,那就是测序数据的泄露。当然,对于这样一个生物技术服务公司来说,要窃取数据的人,可能也不多。这只是一种可能。

说说自从下载到了 report.txt,result.tar文件后,我打开后,发现,不是一代测序那种峰图,也不是一代测序那种所有的碱基都能看到的数据。而是只有变异位点和变异情况的长达12万条目的数据。

梳理文件夹,看见有从第一个染色体到MT染色体,共25个染色体发生变异的,venn图示意表格。从这个单个的表格可以看到样本与人类1000人数据库里,发生的变异,可以直观的看到与

首先,本人是是生物信息学中的小白,只知道生物研究,需要用到的统计学软件叫做SPSS,而且这个软件的P值是很重要的,一般是认为的设定一个值,P<0.05叫做有统计学意义;换句话说,就是说所研究的内容与参考组之间,是有差异的。对于认为的设定了一个值是0.05,当然本质上其实还是可能会出“错误的结论”的,只是可能性较小。

而如今的中国生物医学研究,就个人的观察,本国的研究者,很多是“老鼠饲养员”,虽然中国曾经承担了名声极大的与阿波罗登月齐名的人类基因组计划的1%的工作。但是中国的生物科学研究,却是不折不扣的一直在落后。这可能与明天就是国庆的日子的说法,不大相符。但是大家可以去百度,不敢是从韩春雨在《cell》上玩了了一把母蝗虫闹大观园的闹剧,还是近期出现的单细胞研究热就能出现30岁博导的新闻,可可以对于国内生物学研究领域人才的缺乏有所了解。若不是缺乏相关人才,如何能有一毕业就当上了博导的这种事情?不是因为新兴科研,是因为我们国家实在是一直在落后。这种落后比想象的可怕的多。

下面一段文字摘自简书“2009年3月美国科学家组织的一次会议和随后2010年1月巴黎召开的系列有关会议后,最终由多个国家参与的国际人类表观组协会(International Human Epigenome Consortium,IHEC)在巴黎正式成立。目前这个组织包括:日本的AMED-CREST/IHEC;德国表观组计划项目DEEP;加拿大表观遗传学、环境与健康研究联盟CEEHRC;欧盟FP7 BLUEPRINT 计划;香港表观基因组项目;韩国表观基因组项目;NIH ENCODE计划;NIH Roadmap Epigenomics Program;新加坡表观基因组项目。

上面这个IHEC,国际项目,多国参与,但是没有中国。当我们沉浸在70周年的庆典中的时候,有谁知道,我们正在落后。

有人说,我们也在发展,盖了全世界最多的高楼大厦,修了全世界最长的路,高铁……

但是,这些都哪里和今天的生物科学相关呢?没有之一,我们在落后。

而这个世界,正在抛弃中国。
当,各行各业,停业,庆祝生日的时候,我正在痛苦,痛苦的是,因为上海生物工程有限公司,也是猪一样,居然能够把我的数据“弄丢了,遗漏了”,没有道歉,没有悔意,我要求帮我将前面的数据一起整合分析的时候,那边的一位和齐天大圣姓氏相同的业务员,告知我,只能节后了。这就是 中国的现状。

根本不把这生物研究,医学研究严谨的看待;也根本没把研究数据当回事,而广大的研究人员呢?就是这些上海生物工程有限公司的客户呢?多半也是将就着研究一下,像我这样执着的人,真不多。

这样的数据缺失,如果不是我发现了,他们公司根本不管;我发现了,他们只是敷衍给与结论。
我要求予以初步分析,竟然回答节后,那就是一周后了。

这就是现状。

现状是,我们真是值得庆祝吗?

(责任编辑:千金散人)
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