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人类基因及功能网站Genecards介绍

时间:2019-08-23 15:55来源:人科学blog 作者:生茶 点击:
首页 业内资讯 企业动态 GeneCards :基因信息最全面的网站 https://www.genecards.org/ 如果要看基因的序列,我们可以去NCBI,UCSC和ENsembl;如果要看这个基因的蛋白功能,那可以去uniprot那么有没
GeneCards :基因信息最全面的网站

如果要看基因的序列,我们可以去NCBI,UCSC和ENsembl;如果要看这个基因的蛋白功能,那可以去uniprot……那么有没有一个网站可以把基因的这些信息汇总到一起的呢?

 

就是:

 

GeneCards(http://www.genecards.org/)

 

我们先看一下这个网站的介绍吧:

 

 

 

GeneCards是一个可搜索的综合数据库,它自动整合约125个网络来源的基因的数据(包括基因组,转录组学,蛋白质组学等),怎么样是不是感觉很厉害,那么接下来我们来看一下这个神奇的网站吧。

 

在搜索基因进入主界面以后,我们可以在页面的顶端看到这样子的信息,这个是网站基本信息的小标题,仔细看一下是不是很详细!

 

 

 

我们以P21基因为例看一下这个网站的一些常用的基本信息(由于信息太多,没提到的可以自己的挖掘一下):

 

1. 对于一个基因会有很多名字,我们查的可能是基因的曾用名,所以GeneCards中就有一项是Aliases,如下图P21是CDKN1A的曾用名。

 

 

2.我们查一个基因时,常常会在NCBI或UNIPROT上查看这个基因的描述,以便我们快速的了解这个基因。在GeneCards中,把其他网站中对这个基因的描述都放到了一起,不用我们去其他网站看这些信息了,如图。

 

 

3.看完对此基因的描述后,我们可以在Function中观察基因的功能。GeneCards中不仅总结了此基因基本的功能,还包括对于基因GO分析的功能和其基因的临床疾病表型,如图:P21的功能介绍和Go分析。

 

 

 

4.此外,我们还可以在Pathway中观察其可能涉及的通路及PPI。如图:P21涉及的信号通路及PPI;其中标记:R的为Reactome的通路信息(很生动的一个通路网站,有时间再介绍吧),G为Kegg的信息。

 

 

 

 

 

5.在Location中,我们可以观察基因的定位。如图:P21的基因定位。

 

 

 

6.在Expression中可以观察基因在不同组织的表达情况

 


(责任编辑:千金散人)
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